به گزارش روزنامه ترکیه‌ای «حریت»، رجب طیب اردوغان، رئیس‌جمهوری ترکیه چهارشنبه ۲۹ خرداد / ۱۹ ژوئن در سخنانی در استانبول با اشاره به مرگ رئیس‌جمهوری پیشین مصر گفت: «[محمد] مرسی به مرگ طبیعی نمرد؛ او کشته شد». اردوغان وعده داد که پیگیر عدالت در مورد مرگ ناگهانی او باشد: «ترکیه هر کار بتواند برای تعقیب قضایی دولت مصر در دادگاه‌های بین‌المللی انجام خواهد داد». او از سازمان همکاری‌های اسلامی نیز خواهان اقدام درباره مرگ مرسی شد. محمد مرسی دوشنبه ۱۷ ژوئن / ۲۷ خرداد در هنگام برگزاری جلسه دادگاه از حال رفت و درگذشت. پیکر او که به اتهام جاسوسی محاکمه می‌شد، بدون انجام تحقیقات سه‌شنبه ۲۸ خرداد / ۱۸ ژوئن در شهرک نصر قاهره به خاک سپرده شد. جمهوری اسلامی نیز مرگ او را تسلیت گفته است. مرسی پس از تحولات سیاسی مصر در سال ۲۰۱۲ با رأی آزاد مردم نخستین رئیس جمهوری این کشور شد. اسلام‌گرایان اخوان‌المسلمین از او حمایت می‌کردند. پس از کودتا، نظامیان صدها تن از طرفداران اسلام‌گرای او را در محاکمه‌های دسته‌جمعی به حبس‌های طولانی‌مدت و به اعدام محکوم کردند. نهادهای حقوق بشری از این احکام و همچنین از شیوه حکومت‌داری اقتدارگرایانه عبدالفتاح السیسی، رئیس‌جمهوری کنونی بارها انتقاد کرده‌اند. شماری از اعضای بلندپایه اخوان‌المسلمین نیز به ترکیه پناهنده شدند. اردوغان روابط خوبی با اخوان‌المسلمین دارد. امارات متحده عربی و عربستان سعودی، حامیان السیسی، اخوان‌المسلمین را تهدیدی برای امنیت ملی خود می‌دانند.