ابراهیم رئیسی در یک رای‌گیری که با کمترین میزان مشارکت همراه بود به عنوان هشتمین رئیس‌جمهوری ایران معرفی شد. در این دوره از انتخابات میزان آرای باطله به شکل چشمگیری افزایش یافت. نمایندگان مجلس و رسانه‌های نزدیک به ابراهیم رئیسی و نهادهای نظامی دولت و وزارت‌کشور را عامل مشارکت پایین و افزایش آرای باطله می‌دانند و خواستار رسیدگی به تخلفات وزیر کشور شده‌اند. در همین رابطه علی خضریان، سخنگوی کمیسیون اصل ۹۰ مجلس گفت که قریب به هزار شکایت از طریق دبیرخانه و اعضا از طرز کار وزارت کشور به عنوان مجری برگزاری انتخابات در خصوص نحوه اجرای انتخابات و مشکلاتی ناشی از این نوع عملکرد برای مردم ایجاد شده است و به کمیسیون واصل شد. او «شباهت زیاد تعرفه‌های رای‌گیری» در روز انتخابات را دلیل افزایش شمار آرای باطله عنوان کرد و افزود: تشابه ظاهری تعرفه های اخذ رأی در حوزه هایی که قرار بود یک کاندیدا برای سه انتخابات میان دوره ای مجلس، خبرگان رهبری و ریاست جمهوری از سوی مردم انتخاب شوند مشکلاتی را برای رأی دهندگان ایجاد کرده بود و یکی از دلایل میزان بالای آرای باطله و مخدوش در این دوره نسبت به ادوار گذشته انتخابات وجود همین مشکل در روند برگزاری بوده است. همچنین شکایات شفاهی در جریان برگزاری انتخابات به علت تاخیر در آغاز روند رأی‌گیری، کمبود تعرفه، نبود مهر، کمبود ناظر و بازرسین وزارت کشور در برخی از حوزه های سراسر کشور نیز به کمیسیون واصل شد. به گفته خضریان این کمیسیون در نامه‌ای به وزیر کشور خواستار پاسخگویی به این مسئله شده و در این رابطه تشکیل پرونده داده است.